神經機制參與了大多數疾病的發病，有些因素直接損害神經系統，如流行性乙型腦炎病毒。另一些致病因子可通過神經反射引起相應器官組織的功能代謝變化，或者抑制神經遞質的合成、釋放和分解，促進致病因子與神經遞質的結合，減弱或阻斷正常遞質的作用。最常見者為早期精神緊張、焦慮、煩惱導致大腦皮質功能紊亂，皮質與皮質下功能失調，導致內臟器官功能障礙。