1.分離培養

　　（1）糞便：一般將糞便或肛拭直接接種于SS和麥康凱平板上，用兩種培養基的目的是為提高標本的陽性檢出率。

　　（2）血液和骨髓：抽取患者血液5ml或骨髓0.5ml，立即接種于含0.5%膽鹽肉湯或葡萄糖肉湯5ml試管中進行增菌，48h將培養物移種到血平板和腸道鑒別培養基上，若有細菌生長取菌涂片革蘭染色并報告結果。對增菌培養物連續培養7天，仍無細菌生長時，則報告陰性。

　　（3）尿液：取尿液2～3ml經硫磺酸鹽肉湯增菌后，再接種于腸道菌選擇培養基或血平板上進行分離培養，亦可將尿液離心沉淀物分離培養。

　　（4）局部感染的膿液。

　　2.鑒定：沙門菌屬的鑒定與志賀菌屬相同，須根據生化反應和血清學鑒定兩方面進行。

　　1）初步鑒定：如為革蘭陰性桿菌時作氧化酶試驗，陰性時，挑取可疑菌落分別移種于KIA和MIU上。并作生化反應。以沙門菌多價診斷血清作玻片凝集試驗。

　　凡符合KIA：K／A、產氣+／-、H₂S+／-、MIU：動力+、吲哚-、脲酶+，氧化酶-，觸酶+，硝酸鹽還原+，以沙門菌多價血清作玻片凝集試驗陽性，鑒定為沙門菌屬。

　　2）最后鑒定：沙門菌血清學鑒定主要借助于沙門菌O抗原多價血清與O、H、Vi抗原的單價因子血清。甲型副傷寒沙門菌、鼠傷寒沙門菌和傷寒沙門菌分別屬于A、B、D血清群。

　　3.血清學診斷：肥達試驗：用已知的傷寒沙門菌0、H抗原，甲乙丙副傷寒沙門菌H抗原稀釋后與被檢血清作定量凝集試驗，以檢測患者血清中抗體的含量，來判斷機體是否受沙門菌感染而導致腸熱癥并判別沙門菌的種類。