中國CDC（疾病預防控制中心）病毒病預防控制所進行的國內首次大規模乙腦分子流行病學研究發現，目前我國同時存在基因3型和基因1型兩種乙腦病毒，新分離病毒與我國目前所應用的乙腦減毒活疫苗株在重要結構蛋白基因區段氨基酸位點特征無較大變化，我國當前流行的乙腦病毒完全可通過國產乙腦疫苗免疫預防。

　　中國CDC病毒病預防控制所副所長梁國棟研究員介紹，研究人員首先基于1990年至2000年全國乙腦流行病學資料與乙腦發病率分析，劃分出我國乙腦高、中、低流行區及非流行區，并于2001年至2006年連續6年在不同流行區采集蚊蟲及腦炎病人血清、腦脊液標本，所捕獲蚊蟲達10余萬只，采集標本的范圍包括10多個省區。研究發現，蚊蟲攜帶乙腦病毒的比例與蚊蟲種類密切相關，庫蚊屬蚊蟲攜帶病毒比例最高，特別是三帶喙庫蚊是攜帶乙腦病毒最主要的蚊種。比較發現，乙腦高流行區的三帶喙庫蚊攜帶乙腦病毒率明顯高于低流行區。

　　該研究新分離鑒定了80余株乙腦病毒，對其全部進行了基因測序。結合以往分離的乙腦毒株，科研人員共對百余株我國分離的乙腦毒株進行了分子生物學研究。從而發現，目前我國同時存在基因3型和基因1型乙腦病毒。于黑龍江、北京、陜西、貴州、福建分離到的毒株均屬于基因3型，于河南、廣西分離到的毒株屬于基因1型，于遼寧、四川、上海、云南分離到的毒株為兩種基因型別混雜。